Pré-aqueça o forno a 180°C / 350°F. Forre uma forma de muffins com forminhas de papel ou unte levemente com óleo de coco.
Misture os ingredientes líquidos. Em uma tigela grande, bata os ovos, o iogurte grego, o açúcar mascavo e o extrato de baunilha até obter uma mistura homogênea e bem combinada.
Adicione os ingredientes secos. Peneire a farinha de batata doce, o cacau em pó, o fermento em pó, o fermento químico e o sal. Misture até formar uma massa espessa e uniforme. Não misture em excesso.
Incorpore as gotas de chocolate, reservando uma pequena porção para cobrir.
Divida a massa uniformemente nas formas de muffin, enchendo cada uma cerca de ¾. Cubra cada muffin com algumas gotas de chocolate reservadas.
Asse por 18–22 minutos, ou até que um palito inserido no centro saia limpo ou com apenas algumas migalhinhas úmidas (sem massa crua). Os muffins devem estar firmes e levemente crescidos no topo.
Deixe esfriar na forma por 5 minutos, depois transfira para uma grade. Os muffins firmam conforme esfriam. Não corte antes da hora.